农村基层治理能力是农村战斗力的保障, 是落实和完成党在农村各项政策的能力支撑, 更是发挥乡村振兴战略的关键力量和重要源泉。要想充分发挥农村基层治理能力，使农村党组织领导力量在实现乡村振兴战略中发挥重要作用，需要各方积极履行职能职责，这是处理好乡村振兴战略与农村基层治理的重要方式。
实施乡村振兴战略和实现农村基层治理必须以社会发展条件和时代背景为前提，不断地深入探讨农村发展的关键任务与目标，精准分析农村经济发展面临的问题，提出有针对性的对策，为巩固党的基层执政能力打下坚实基础。
1.管理运行机制不够完善。
农村基层管理运行机制不够完善，是当前农村基层治理面临的重要困境。在农村基层管理运行机制中，基层党组织是中国共产党在农村发展的重要执政基础和骨干力量，对农村基层治理有重要的促进作用。一旦在管理运行机制方面出现问题，不仅会对农村经济发展产生一定的阻碍作用，更会不利于农村基层党组织在治理能力上进行提升和改进。长此以往，会成为当前农村基层治理的主要制约因素。
2.基层自治组织影响力较弱。
农村基层自治组织影响力不断弱化，也是困扰当前农村基层治理的重要难题。农村基层自治组织包括自治组织本身的建构框架和组织内部的结构划分。农村基层自治组织体系的科学构建和公共服务能力的全面覆盖，不仅有利于加强基层党组织朝着更好的方向前进，更能够巩固其领导核心地位，此举也是实现乡村振兴战略的制度保障。在当今农村发展已然落后的背景下，原有村庄数量减少，相关人口密度骤降，绝大多数农村基层自治组织框架体系存在短板以及人员责权利不明确的问题，也会从整体上影响农村基层自治组织的影响力、公信力。
3.优质后备队伍数量减少。
在农村基层自治组织的人员构成方面，优质的后备队伍数量在不断减少，因为具有一定知识能力、文化素养，对农村经济发展有一定见解的人大部分前往城市另谋发展。与此同时，受市场经济大潮的冲击，部分党员的主人翁意识及政治责任感有所弱化，导致农村基层自治组织的影响力出现一定的下滑。
1.转变基础治理理念。
转变治理理念必须要做到以领导力建设为根本原则。实践证明，在转变治理观念的过程中，把握思想引领的作用十分重要。在农村社会各个领域中，通过领导力建设，对重大问题、重大事项进行真正意义上的把握，实现管理型治理观念向服务型治理观念的转变，充分保证基层工作方式的权威和力度。
2.创新基层工作方式。
创新基层工作方式，发展思路的转型升级，不仅是引领农村经济高质量发展的内在动力，更能使农村基层党组织通过自我革命带动乡村社会革命，保证基层工作方式的先进性和纯洁性。发展力建设环节中，最不能忽视的一点是，严格贯彻落实基层党建工作责任制，此举既能成为农村基层治理的重要保障，又能成为乡村振兴战略全面实施的重要抓手。
3.提高村民素质水平。
提高村民素质水平，需要不断优化农村基层干部年龄结构，选拔有才能的年轻人进入到可培养的梯队中去，这也是乡村振兴战略下农村基层治理能力提高的重要方式。在农村基层干部结构优化层面, 一方面要坚持把政治标准放在首位，加大从农村优秀青年群体中培养基层人员的工作力度，提升基层队伍质量；另一方面要建立基层干部建设管理的相关细则，村党支部要根据农村的社会生产和生活实际增强农村基层人员教育管理的针对性和有效性，担负好直接教育、管理、监督的职责，使其真正为全面实施乡村振兴战略、提高农村基层治理能力而服务。